八国联军杀入北京，慈禧逃到西安。庚子赔款后，慈禧返回，沿途迎接的大小官员及士兵，都跪下迎接。 慈禧御驾路过小站，段祺瑞及手下士兵站立迎接。 载沣喝令：“跪下！” 段祺瑞及士兵依然挺立。 载沣大怒，拔刀要砍段祺瑞的腿；段祺瑞扛枪昂然而立，怒目而视，卷出凛然不可侵犯之气势。 当时守卫京城的清廷禁军被八国联军消灭，要靠新军；慈禧害怕激起兵变，做出宽宏大量状，不追究。慈禧死后，载沣成为摄政王，段祺瑞依然不跪，因此受到清贵族的排挤，被解除兵权，任保定军校校长，在此期间培养出了一批杰出的军事人才，直到袁世凯重获重任才重新被重用。
段军不跪这事是真的，但载沣拔刀这事是假的；袁世凯下台后段祺瑞去当校长不是受到排挤，而是主动要求辞职以向中央施压好起复袁。
