警总是打压人民的恐怖组织。1945年9月，台湾省警备总司令部（警总）在重庆成立，主要目的是为了接收台湾与维持治安，首任总司令是陈仪。在1949年的“戒严”体制下，警总可随时进入公民家中检查户口，审查和惩罚书报杂志，可制止、解散公民的游行集会，可禁止公民罢工、结社，可对公民的出入境自由进行严格限制，可任意拆阅、扣留或没收公民的私人邮件、电报，乃至以军法来审判非军人的一般公民，等等。一句话，“宪法”赋予公民的大多数基本权利几乎都被无情剥夺。戒严时期，警总是当局打击异己的最佳工具，箝制思想与言论自由是其特色，警总炮制的冤狱不计其数。“新台湾新闻周刊”在2007年7月19日报导，据法务部资料，台湾在戒严时期，军事法庭受理的政治案件有29407件，无辜被害者约14万人。司法院资料指出：政治案件约6、7万件，如以每案平均3人计算，受军事审判的政治受难者，应在20万人以上。陈文成命案是警总的代表作之一。李登辉执政后，警总卸下打压台湾人民的任务，在1992年改制为“海岸巡防司令部”（海巡部），2000年再变为行政院海巡署。
一，陈文成被蒋经国害死
陈文成（1950年1月30日－1981年7月3日）生于新北市，1968年建国中学毕业，大学联考以总分500分，全国第2名成绩考上台大数学系。1975年陈文成获得美国密歇根大学的奖学金，前往密歇根大学就读数学研究所，取得美国保险公司“精算师”的头衔，1978年获得密歇根大学获颁博士学位。陈文成在卡内基美隆大学担任助理教授，积极参与同乡会、人权会。
陈文成在1979年9月与施明德通电话、捐助《美丽岛》杂志5000美元时被监听，情治机关开始对陈文成这电话号码进行长期监控，因此,早早知道陈文成会在1981年5月份带太太跟儿子返台探亲。此外，情治机关也透过其他管道监控陈文成在美国的活动，包括参加台湾同乡会、筹备全美民主基金会。
陈文成回台湾后亦有跨机关协查、线民跟踪，警总对陈文成的电话监听等比在美国更严密。家人经常接到查询、骚扰电话。6月，陈文成到南部拜访朋友，就差点发生刻意制造的车祸。陈文成预定在7月1日返美，但是出境证却被警总扣留。7月2日一早，警总把陈文成从家中带走；7月3日陈文成陈尸台大校园研究生图书馆旁的草地上；案发后，警总指称陈文成“畏罪自杀”，后来又改口是“意外死亡”。陈文成的离奇死亡轰动海内外，被称为“陈文成事件”。
1975年蒋中正逝世，继任独裁者蒋经国除面对对岸宿敌中共外，更要面对台日益高涨的党外势力，更担心在纽约行刺他的黄文雄与郑自才所属的台独联盟，于是将海外的台独和岛内的党外与对岸的中共合为“三合一敌人”，敌人当然要歼灭。1978年4月10日蒋经国在日记里说：“内忧者在于国内少数野心家和卑鄙的败类如康、黄、张、林之类。被共匪所利用从事破坏捣乱和打击，余决以沉着坚定而对之。政治是不讲情面的，绝不可上当。”康指康宁祥、黄是黄信介、张是张俊宏、林是林义雄。蒋经国以为这些人的后台是“共匪”，于是有1979年的“美丽岛事件”与1980年省议员林义雄宅的“林宅灭门血案”。
“林宅灭门血案”特意选在“美丽岛事件”军法大审军事法庭第一次开庭的1980年2月28日同一天，有其深沉的含意，意在警告所有台湾人，你们难道这么健忘，竟然忘记33年前228事件？“美丽岛事件”将岛内党外带头者一网打尽后，下一个目标当然是海外台独，于是自美回台的陈文成成为下手最理想的目标，因为他曾由美国捐助巨款给《美丽岛杂志》，必然是海外台独的重要份子。
警总想由陈文成口中套出，证实海外台独与岛内党外确有连手之阴谋。陈文成第一次被约谈的笔录与6卷录音带，现在保存于国家挡案，内容大意是：1、他在美国帮忙成立基金会，为《美丽岛杂志》募款。2、他汇款给《美丽岛杂志》总经理施明德。3、他在匹兹堡帮忙找到翻译者，将《美丽岛杂志》译为英文版发行。4、在台期间，曾和一些人谈及如何促使与立法以进行民主政治改革。
但是没有第二次被约谈的笔录与录音带，显然是当局销毁了。在第一次约谈中，没有套出任何讯息，所以有第二次约谈，陈文成不愿意交代，就被严刑拷打，许多内脏器官严重受损。台北地检处开立的死亡证明书：“高处坠落，出血过多休克致死”，验尸所发现之尸检情况为右后背肋骨折断9支，左侧折断3支，腹腔积血严重。肝肺破裂，肾脏一边破碎、一边肿胀，耻骨断裂（下体遭重击），满身刑求伤痕。
陈文成的二姐陈宝月说，“陈文成的脖子曾被电击棒电击，十根指甲曾被细针刺，五脏六腑都被打烂了，生前还被灌毒药，家属捡骨时发现骨头都是黑的。”一切都指向陈是生前遭严刑拷打并灌毒致死，警总为了掩饰罪行，制造自杀的假象。
由于这个事件涉及国民党在美国校园内雇用学生当特务，并对台湾学生的言行进行监控，因此在台美人社区和美国媒体都引起了极大的回响。因为陈文成是美国公民，而台湾那几年的人权记录在国际上又一直不好，所以这件事惊动了美国国会，美国国会曾在当年10月举办过听证会，就国民党在美国校园安排学生当特务一事进行调查。
当年9月来台验尸的美国卡内基美伦大学的法医韦契特，返美后，在匹兹堡举行记者会表示：“陈文成不可能死于自杀，也不可能死于意外，而是死于他杀（homicide）” 。韦契特怀疑陈文成被人打昏后抛下，韦契特看了血液毒性分析后认为有几项检验没做，要求采下若干组织回匹兹堡化验，却被拒绝。
身负重伤而陷于昏迷者又何能走到台大研图馆，爬上消防梯5楼跃自杀，在“更为严密的监控措施”下，警总人员竟是全然不知不觉？唯一合理的解释是陈文成之死全然是警总一手为之的政治谋杀案。警总将昏迷不醒的活人，由消防梯抛下而致死，是谋杀罪。陈文成之死，不过是情治单位的故技重施，只是在台北所有铁路都巳地下化，再找不到铁轨，而卧轨自杀也不像是读书人的作法，最后找到适如陈文成教授学界身分的台大研图馆，以自杀的假象掩盖杀人而无法灭尸的事实。
其后韦契特撰写“发生在台湾的谋杀案”（Murder in Taiwan）一文发表于1985年6月的《美国法医及病理学》的学术期刊上，直言陈文成系被谋杀，并提及“陈尸的位置和伤势吻合被人平抬以平行于楼梯栏杆的姿势抛下的推论”。2009年的美国电影《被出卖的台湾》的剧情中融入陈文成遭谋杀的元素。
美联社记者周清月因为在报导陈文成案中用了“验尸”一词形容美国病理学专家韦契特对陈文成遗体的调查，引起了新闻局局长宋楚瑜不满，认为她“损害国家主权和法律尊严”，应该是观看陈文成的尸体，要周清月写悔过书不果而于1981年9月26日吊销周清月采访证，引起国际媒体轩然大波。
二，促转会揭露真相
2011年7月2日，一群台大师生与来宾为陈文成在当年事故现场举办了纪念晚会，由所有参加者捧着烛光和一块石头，堆在现场一颗大树下围成一圈，用行动艺术象征由民众为陈文成立碑。前台大研究生协会会长林欣晔创作名为“31岁”的歌曲，以纪念31岁离世的陈文成，而2012年又适逢事件发生31周年。2015年3月21日，台大校务会议正式通过，将其陈尸地点命名为“陈文成事件纪念广场”。
2020年5月4日，促转会举行“陈文成案调查报告记者会”。促转会发布陈文成案调查报告，以档案与新法医鉴定指出过去警总的“畏罪自杀”说漏洞百出；过去陈文成背部被视为坠楼后撞击水沟的伤痕，经台大法医所教授李俊亿重新鉴定当年法院卷证，指出这是“长条状有不规则边缘的钝状物体”造成之致命伤痕，非坠楼后形成。
调查小组召集人、促转会兼任委员尤伯祥表示，陈文成在大清早从住处被带走、家人与朋友都联系不上，隔天被找到已是尸体在水沟上，且尸体样貌很奇怪，皮带系在肚脐上方，鞋子一只脱落、几天后找到里面有放纸钞，这都让家属与社会大众怀疑死因不单纯。尽管该年7月4日便有些媒体认为全案应往“他杀”侦办，包括家属都觉得是情治机关涉嫌，但过去7次报告一直不能厘清情治机关的角色到底是什么，也是促转会再启调查的原因。
警总所谓“侦讯完把陈文成送回家”的说法是有问题的。就警总说法，侦讯后有在夜间9点半送陈文成回到罗斯福路住处，回去1小时后陈文成到本案证人之一、其友人邓维祥家中，约凌晨12-1点间离开，再一个人回到台大，可能在研图上因为“心绪不宁”坠落，可能是自杀──过去官方调查皆接受这般说法，但尤伯祥表示，本次促转会经调查从档案分析，发现这叙事可谓“漏洞百出”。
据警总说法，陈文成是当天早上9点到警备部保安处，晚上9点派车送回家，待了12.5小时，但尤伯祥说，就目前档案留存的录音译文只有6小时、找不到原先的录音带，译文还有许多删节号、前言不对后语，无法确知陈文成在警总遭受怎样的对待。
至于“送返住处”一说，经促转会调查，陈文成住处离被侦讯地点仅2公里，警总虽声称是晚上9点半将陈文成送返，但就证人目击军官护送过程的说词，是在“晚上10点半”看到陈文成与军官的──从爱国西路送回陈文成的住处、短短2公里开车竟能花上一小时，这时间点显然不合理；此外，就目击证人说法，看到的陈文成与护送军官是“一高一矮”的两名男子，但经促转会调查，发现两人身高只差1公分，陈文成身高168公分、所谓军官167公分，这说词也有漏洞。
至于警总声称陈文成侦讯结束后去找的友人邓维祥，其说词也有诸多漏洞。邓维祥说陈文成在他家写了封信，但陈文成的陈尸现场没有找到这封信、警总后来下令追查也找不到；邓维祥表示陈文成有说自己可能会被判刑10年以上、请他照顾妻小，但当陈文成丧命消息传出，邓维祥第一时间找的也不是其家人，而是找警总作证。
此外，虽然有证人表示凌晨1点半看到陈文成登上台大研图楼梯，但1982年官方“明园专案”调查、现场验证两位目击证人说词，就已证实根本不可能在证人所讲的位置看到陈文成、或目击陈文成走上楼梯。
本次促转会调查也经台北地检署协助得到当年陈文成遗体相验完整卷宗画面、由台大法医所教授李俊亿再次鉴定，得出第三个发现是：陈尸处并非第一现场，他杀可能高。尤伯祥说，第一疑点是虽然当年相验结果认为陈文成从研图5楼阳台掉下来，撞到2楼平台，跌落水沟上造成背后伤痕，问题是陈文成尸体被发现时是与水沟“平行”，遗体照片上的伤口却是“垂直”的；再者，旁边草地其实比水沟边缘更高，陈文成掉下来的话背部撞不到水沟边缘，无法造成那样的伤痕。
此外，陈文成的衬衫破裂痕刚好与陈尸方向一样，鉴定人李俊亿认为造成伤痕必然是“长条状有不规则边缘的钝状物体”所致，且衬衫破裂痕下方有血迹，应是尸体受到致命伤痕后慢慢渗血又遭拖拉造成──即，陈文成的伤势跟衣服裂痕都非撞击水沟造成，陈文成遗体被发现的位置并不是第一现场，其受到致命伤害（背部两条）后曾被外力移动过。
最后一个发现，是情治单位介入侦办、阻碍家属追求真相。尤伯祥表示，陈文成案发生后，地检即被警总架空，侦办方向被警总决定、定调，案件就是“畏罪自杀”，且侦查方向定调后情治机关也持续监控家属，不可对案件有质疑。因此，家属陈庭茂无论是发表纪念文集、在国外求援都被警总阻碍，警总甚至在陈家人内部造成分化，任何跟“自杀”相反的说词都不能在台湾社会流通，而种种掩盖真相的行为，也强化了警总涉案嫌疑。
而1982年“明园专案”成员汪敬煦给蒋经国的签呈，其中写到落体实验结果已完成、“不排除由相识者于谈话中有意或无意发生碰撞而导致重心外移跌落之可能，原推断存有自杀之可能性应予排除”、暗示本案有他杀可能，虽然蒋经国对此面谕“应继续加强侦查办理”，但之后检调的方向还是维持“自杀论”，意“非自杀”的说法不能在国内流通。
综合以上发现，尤伯祥表示，警总确实涉有嫌疑。但尤伯祥也说，调查只是一个阶段，无法确定到底是不是真的警总所为、谁做了这样的事情，这些都有待下阶段再进行调查。
三，纪念陈文成被害39周年
2020年7月2日，陈菊发文指出，39年来，陈文成博士的家人和社会大众，始终不知道那一天发生了什么事？陈菊提到现在的景美看守所里头有一条历史长廊，上面刻满政治犯的名字。“他们在最黑暗的年代勇敢站起来反抗、牺牲生命，他们的名字在风中、雨中，但台湾社会不知道他们是谁。”
陈菊说，“我始终相信，‘心里有天堂的人，就不怕被钉在十字架上。’推动转型正义是台湾脱胎换骨的历史工程，让历史真相大白是公道的基础，如果没有历史真相、就没有真正的公平与和平。在担任总统府秘书长时，我参与了政治档案解密的工作，促转会也在解密档案的基础上进行调查，针对陈文成事件和林家血案等案件都有新的进展，但仍然有许多真相等待更进一步的挖掘”。
台大学生会、台大研究生协会、陈文成基金会、美国陈文成基金会，2020年7月2日晚在大雨中举办“陈文成事件39周年纪念晚会”，赖清德副总统、促转会主委杨翠、国史馆长陈仪深、国家人权馆馆长陈俊宏、陈文成博士纪念基金会董事长杨黄美幸、美国陈文成基金会董事长黄静芝、陈文成博士纪念基金会董事杨维哲、黄启瑞、周婉窈以及白色恐怖受难者蔡焜霖、陈钦生、台大历史系教授陈翠莲等人均出席晚会，和民众一起默哀、献花。赖清德强调，转型正义不会停止，促转会持续运作调查。
台大教授陈翠莲指出，2020年，如果陈文成还健在，他今年刚好70岁，1981年那一年陈文成31岁，他刚刚取得了博士学位，在美国的卡内基美隆大学任教，他的小孩刚刚出生，美好的人生刚要开始，可是因为他关心自己的家乡，回到台湾被约谈后失去生命。
杨黄美幸说“陈文成在美国生了一个儿子，很高兴的要带回台湾给父母看，却无缘无故遇害。陈文成的二姐陈宝月曾说，国民党欠她一个道歉，陈文成开开心心的从美国返台，竟说他是自杀？这对她是个侮辱！其实中国国民党欠台湾人很多道歉，中国国民党要出来承认错误。
促转会主委杨翠说：“从史料当中看到一个有陈文成的侦查计划，可是那个计划我们没有办法找到档案，还有相关的访谈录音带，也没有办法找到，在第一阶段希望能够有进一步的事件厘清。”她也重申，为了持续挖掘真相，促转会将持续运作，尽力调查。
政治受难者蔡焜霖说：2018年5月17日，国家人权馆白色恐怖绿岛纪念园区挂牌的那天，他是代表第一批被送到绿岛的政治犯，当时他拜托在场的蔡英文总统，调查绿岛再叛乱案被处死的那几个年轻人，到底是谁杀了他们，还有在往后的白色恐怖历史里面，把年轻人当作非杀尽不可的敌人到底是谁，并不是某一个特务、军法官或情资单位的人，而是最高的决策者。
元璋屠杀大臣和将军，太子朱标反对！皇帝把荆棘条丢在地下，要太子捡，太子怕扎手，不敢捡！皇帝命人削掉荆棘条上的刺，太子就捡了！朱元璋说，我杀他们就是在削刺，这样你才能坐稳江山啊！蒋经国为了他儿子能世袭政权，竟然杀害留美博士！
